Au sud de Castello d’Empuries, jusqu’à l’Escala, s’étend une vaste zone humide, seconde en superficie de la Catalogne : ces terres de marécages (aiguamolls) constituent un refuge d’importance pour de nombreuses espèces d’oiseaux notamment, et demeure reconnue comme un terrain propice à l’observation ornithologique. Hérons, martin-pêcheurs, flamants et cigognes comptent parmi les espèces remarquables qui peuplent les marais.
Dans le souci de protéger sa richesse naturelle tant pour ce qui est de la faune que de la flore, les marais de l’Emporda ont été classé comme réserve naturelle.
Un centre d’information a ainsi été créé : pour s’y rendre, il faut emprunter la route reliant Castello d’Empuries à Sant Pere Pescador, puis tourner en direction d’El Cortalet. C’est de ce centre que partent les itinéraires de découverte de la région. On y trouve dans un premier temps de nombreuses informations concernant la réserve et son fonctionnement naturel, avant de partir en excursion, par des chemins balisés ponctués de postes d’observation. Des jumelles sont à louer au centre d’information. A noter que les meilleurs saisons pour l’observation demeurent les périodes migratoires, de mars à mai, puis d’août à octobre.

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