Construite par le calife fatimide Al Aziz ainsi que son fils Al Hakim en 1013, la mosquée Al Hakim a été largement inspirée de la mosquée Ibn Touloun. Son architecture, aux tours massives et aux piliers robustes lui donnent un aspect de puissance. La mosquée est surplombée de deux minarets ornés de motifs floraux et géométriques. Nombreux éléments d’origine ont été préservés dans la mosquée : tels que le transept avec ses arches et ses piliers, le dôme au-dessus du mihrab ainsi que quelques arches de chaque côté du transept. Une Les frises en stuc conservent une décoration ayant résisté durant tous des siècles et sont ornées d’inscriptions koufiques. L’originalité se retrouve également au niveau des poutres des arches sculptées dans le bois, sous le dôme.
Mesurant 120 mètres de large et 113 mètres de profondeur, la mosquée d’Al Hakim dispose de nombreuses entrées en plus de l’entrée principale qui se trouve au milieu de la façade ouest. Les plus importantes sont celles qui se situent à gauche et à droite de l’entrée principale ainsi que celles qui se trouvent au centre des façades Nord et ouest.
Un lieu très majestueux qui n’a pourtant servi que très peu de lieu de culte. La mosquée fut d’abord une prison, puis une écurie, un entrepôt, une école de garçons et même un asile d’aliénés.